どこから見てもメンダコ

軟体動物門頭足綱八腕類メンダコ科

2018-10-20から1日間の記事一覧

RDkitで分子フィンガープリントの生成

RDkitで各種の分子フィンガープリントの生成を行います。 マルチSDF読み込み delaney水溶解度データセットから作成したマルチSDFを読み込みます。 horomary.hatenablog.com from rdkit import Chem mols = Chem.SDMolSupplier('delaney_multi.sdf') for mol …

RDkitでSMILESからSDFの作成

SDF形式にすることで、立体構造を要求する処理が可能になるのはもちろんですが、目的変数と化合物構造を紐づけておくことができるので間違いが起こりにくいという利点があります。 サンプルデータ 例のごとくdeepchem付属のdelaney水溶解度データセットを使…