どこから見てもメンダコ

軟体動物門頭足綱八腕類メンダコ科

deep learning

Mask-RCNNで細胞画像のインスタンスセグメンテーション

はじめに 3D空間スキャンなどのソリューションを提供しているmatterport社がMask-RCNNの実装をOSSとしてgithubに公開してくれているので細胞画像のインスタンスセグメンテーションをやってみました。 github.com matterport.com この実装の最大の特徴は矩形…

AutoML Visionでお手軽Object Detection(工業製品の傷検出)

Google Cloud AutoML Visionがいつの間にか物体検出に対応していました。 定義済みカテゴリの検出だけでなく、自作データセットのラベル付けから物体検出器の訓練・テストまでをGUIで行えるサービスです。 cloud.google.com www.atmarkit.co.jp というわけで…

kerasで化合物SeqToSeq Autoencoder

化合物VAEを作ろうとしたのですが、VAEは思ったよりややこしかったのでとりあえず化合物AEをしました。 はじめに 化合物構造(smiles)を入力し、次元圧縮した後に化合物構造(smiles)を復元するautoencoderモデルを作成します。 VAEではないので化合物生成に…

Deepchm③(グラフ畳み込みで回帰)

分子グラフの畳み込みモデルでdelaney-水溶解度データセットの回帰を行います。 csvデータのロード 例のごとくdelaney水溶解度データセットをロードします。 MPNNモデルやCoulomb matrix featurizerなどを使いたい場合は立体構造が必要ですが、ConvMolFeatur…